Σε 351 ανέρχονται τα νέα κρούσματα κορονοϊού στην Ελλάδα στη χώρα μας τα οποία αποδίδονται στη μετάλλαξη Όμικρον, σύμφωνα με τα αποτελέσματα των ελέγχων του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 για το διάστημα 1/12/2021 – 3/1/2022.
Συνολικά, τα επιβεβαιωμένα περιστατικά με την Όμικρον ανέρχονται σε 717. Η κατανομή τους καταγράφεται στους πίνακες της παρακάτω ανακοίνωσης του ΕΟΔΥ. Ωστόσο, οι εν λόγω έλεγχοι δεν αφορούν στο σύνολο των κρουσμάτων με τη συγκεκριμένα παραλλαγή.
Η εκτίμηση των υγειονομικών αρχών είναι, άλλωστε, πως το ιδιαίτερα μεταδοτικό στέλεχος του ιού αυτό αφορά ήδη στην πλειοψηφία των νέων μολύνσεων στη χώρα.
Ολόκληρη η ανακοίνωση για τις μεταλλάξεις του κορονοϊού στην Ελλάδα:
«Ολοκληρώθηκε από το Eθνικό Δίκτυο Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2, που λειτουργεί υπό το συντονισμό του ΕΟΔΥ, η γονιδιωματική ανάλυση σε 1.007 δείγματα που έχουν επιλεγεί τυχαιοποιημένα ή στοχευμένα και αφορούν στην περίοδο 01 Δεκεμβρίου 2021 έως 03 Ιανουαρίου 2022.
Από τον έλεγχο των 1.007 δειγμάτων, αναδείχθηκαν συνολικά 976 δείγματα με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος
(Variants Of Concern – VOC).
Εκ των 976 δειγμάτων με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος, τα 625 αφορούν στο στέλεχος Delta, και 351 αφορούν στο Omicron (Πίνακας 3).
Δεκαεπτά εκ των 625 στελεχών Delta αφορούν στο στέλεχος Α.Υ.4.2, τα οποία εντοπίστηκαν σε δεκαεπτά εγχώρια κρούσματα στις Περιφερειακές Ενότητες της Αργολίδας (13), του Βορείου Τομέα Αθηνών (1), του Λασιθίου (2) και της Λέσβου (1).
Από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα έχουν ελεγχθεί στην επικράτεια συνολικά 43.888 δείγματα από εγχώρια κρούσματα. Εξ αυτών 39.512 προέρχονται από τυχαία επιλογή δειγμάτων, 3.635 προέρχονται από στοχευμένη λήψη ή επιλογή δειγμάτων και για 741 δείγματα δεν είναι διαθέσιμος ο τρόπος επιλογής.
Μεταξύ των 39.512 τυχαία επιλεγμένων δειγμάτων στην επικράτεια, τα τέσσερα πιο συχνά στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση που έχουν απομονωθεί είναι το Delta με ποσοστό 46,93%, ακολουθούμενο από το Alpha με ποσοστό 39,39%, το B.1.1.318 (Variant E484K) με ποσοστό 5,93%, και το Omicron με ποσοστό 1,45% (Πίνακας 4).
Η διαχρονική εξέλιξη της σχετικής συχνότητας των αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία ανά είδος στελεχών, μέχρι και την εβδομάδα 52 του 2021 απεικονίζεται στο Διάγραμμα 9.
Από τα 3.635 δείγματα που έχουν ληφθεί ή επιλεγεί στοχευμένα, έχουν βρεθεί 3.472 στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση ή ενδιαφέροντος. Από τα δείγματα που έχουν ληφθεί ή επιλεγεί στοχευμένα, 36,62% αφορούν στο Delta, 36,04% αφορούν στο B.1.1.318 (Variant E484K), 14,83% στο Alpha, 5,56% στο Beta, 2,09% στο Omicron, 0,11% στο C.36, 0,08% στο Eta, 0,08% στο Gamma, 0,08% στο A.28 και 0,03% στο Mu.
Επιπλέον, έχουν απομονωθεί συνολικά 547 στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση ή ενδιαφέροντος από δείγματα εισαγόμενων κρουσμάτων, εκ των οποίων 330 αφορούν στο Delta, 113 στο Alpha, 83 στο Omicron, 7 στο Mu, 6 στο Beta, 4 στο B.1.1.318 (Variant E484K), 1 στο Eta, 1 στο C.36, 1 στο Kappa, 1 στο B.1.1 (Variant E484K).
Όσον αφορά στα στελέχη ενδιαφέροντος που χρήζουν άμεσης λήψης μέτρων ελέγχου επί του παρόντος στη χώρα, η γεωγραφική κατανομή ανά Περιφερειακή Ενότητα παρουσιάζεται στον πίνακα 5.
Όμικρον και PCR test
» Η παραλλαγή Omicron (B.1.1.529/BA.1) χαρακτηρίζεται από την παρουσία μιας διαγραφής νουκλεοτιδίων, της διαγραφής 69-70 (del69-70) στο γονίδιο S (Spike) του ιού.
Η διαγραφή αυτή έχει ως αποτέλεσμα την αδυναμία ενίσχυσης ενός εκ των τριών γονιδιακών στόχων, του γονιδίου S, σε συγκεκριμένη εμπορικά διαθέσιμη διαγνωστική δοκιμασία μοριακού ελέγχου (RT-PCR), που εφαρμόζεται σε ορισμένα εργαστήρια στη χώρα μας και ευρύτερα παγκοσμίως.
Επιπλέον, προκαταρκτικός έλεγχος για πιθανά κρούσματα του στελέχους Όμικρον, πραγματοποιείται και με εναλλακτικά πρωτόκολλα μοριακού ελέγχου (RT-PCR), που στοχεύουν στην ύπαρξη συγκεκριμένων μεταλλάξεων σε διαφορετικές περιοχές του γονιδίου S, οι οποίες είναι ειδικές για το στέλεχος Όμικρον.
Θετικά δείγματα που έχουν ελεγχθεί με τα συγκεκριμένα πρωτόκολλα μοριακής διάγνωσης και χαρακτηρίζονται από αδυναμία ενίσχυσης του γονιδίου S, εγείρουν ισχυρή υποψία ότι πρόκειται για πιθανά κρούσματα του στελέχους Όμικρον (B.1.1.529/BA.1) στην παρούσα φάση της πανδημίας.
Η αξιολόγηση του συγκεκριμένου μοριακού ευρήματος κατά τον μοριακό έλεγχο (αδυναμία ενίσχυσης του γονιδίου S) επιτρέπει μια προκαταρκτική εκτίμηση σε πραγματικό χρόνο της επίπτωσης της Όμικρον (B.1.1.529/BA.1) στο σύνολο των θετικών μοριακών ελέγχων.
Η ακριβής εκτίμηση της επίπτωσης της Όμικρον μπορεί να γίνει μόνον με την αλληλούχιση του πλήρους γονιδιώματος του ιού από αντιπροσωπευτικά θετικά δείγματα (γονιδιωματική επιτήρηση). Ακολουθεί διάγραμμα (Διάγραμμα 10) της διαχρονικής εξέλιξης των εν λόγω δειγμάτων στο σύνολο των θετικών μοριακών ελέγχων που διενεργούνται σε δείγματα, αντιπροσωπευτικά του μεγαλύτερου μέρους της Επικράτειας».
