Οι πρυτάνεις δεν ήταν ενήμεροι από το υπουργείο Παιδείας για τις συνενώσεις πανεπιστημίων που φέρνει το σχέδιο «Αθηνά».
Αυτό συζητήθηκε ευρέως και αποτέλεσε κοινή παραδοχή των συμμετεχόντων στο Συντονιστικό Όργανο της Συνόδου των Πρυτάνεων.
Το Όργανο εξέφρασε κατηγορηματικά την αντίθεσή του με τη δημιουργία του Ομοσπονδιακού Ιδρύματος, κατηγορώντας τον υπουργό Παιδείας, Κωνσταντίνο Αρβανιτόπουλο ότι για το σχέδιο αυτό είχαν πλήρη άγνοια.
«Μας αιφνιδίασε όλους. Έπεσε σαν κεραυνός εν αιθρία. Δεν είχε ούτε αναφερθεί ούτε φυσικά συζητηθεί ποτέ τέτοιο σχέδιο, στη διάρκεια των επαφών που είχαμε με το υπουργείο Παιδείας», δήλωσε στην εφημερίδα Ελευθεροτυπία ο πρύτανης του Πανεπιστημίου Πατρών, κ. Γ. Παναγιωτάκης.
Το μοντέλο που συνενώνει κάτω από την ίδια διοικητική ομπρέλα πέντε μεγάλα ιδρύματα της Αττικής, το Γεωπονικό, το Πάντειο, το Οικονομικό Πανεπιστήμιο Αθηνών, το Πανεπιστήμιο Πειραιώς και το Χαροκόπειο, με την ενιαία ονομασία «Αδαμάντιος Κοραής» αποτελεί «μήλον της έριδος» για τους Πρυτάνεις που βλέπουν τις αρμοδιότητές τους να μειώνονται.