Βήμα πίσω από την απόφαση του να αντικατασταθούν οι δύο οικονομικοί εισαγγελείς Γρηγόρης Πεπόνης και Σπύρος Μουζακίτης, δεν κάνει ο Υπουργός Δικαιοσύνης Μιλτιάδης Παπαϊωάννου. Ο κύριος Παπαϊωάννου στο πλαίσιο της συζήτησης του νομοσχεδίου για την αποσυμφόρηση των φυλακών κληθείς να σχολιάσει τις αντιδράσεις που πυροδότησε η πρωτοβουλία του, καταλόγισε «άγνοια νόμου» σε όσους τον επικρίνουν για την απόφαση του.
Μάλιστα σημείωσε χαρακτηριστικά «για το μόνο που μπορείτε να με ελέγξετε είναι γιατί καθυστέρησα και δεν έστειλα το ερώτημα από την πρώτη στιγμή» ενώ επισήμανε πως ο ίδιος είχε ήδη ξεκινήσει την συγγραφή της επιστολής προς το Ανώτατο Δικαστικό Συμβούλιο, όταν ο κ. Πεπόνης επισκέφτηκε την εισαγγελία του Αρείου Πάγου προκειμένου να καταθέσει την δικογραφία της ΕΛΣΤΑΤ. Από την πλευρά του ο βουλευτής της ΝΔ Προκόπης Παυλόπουλος ανέφερε ότι «το θέμα δεν είναι αν έχει αρμοδιότητα ο υπουργός, αλλά πως την ασκεί».