Η αρμοδιότητα στο υπουργείο Υποδομών, ο έλεγχος από το υπουργείο Οικονομικών. Κοινή Υπουργική Απόφαση που υπέγραψαν ο υπουργός Οικονομικών κ. Φίλιππος Σαχινίδης και ο υπουργός Υποδομών, Μεταφορών και Δικτύων κ. Μάκης Βορίδης καθορίζει τους φορείς του υπουργείου Υποδομών που εφεξής θα ελέγχονται από τη Γενική Διεύθυνση Δημοσιονομικών Ελέγχων του υπουργείου Οικονομικών.
Σύμφωνα με την απόφαση, στους φορείς αρμοδιότητας του υπουργείου Υποδομών, Μεταφορών και Δικτύων, οι οποίοι εμπίπτουν στο πεδίο εφαρμογής του Ν.3492/2006 και τους οποίους αφορούν τα συστήματα διαχείρισης και ελέγχου, οι έλεγχοι και τα διοικητικά μέτρα και κυρώσεις του υπουργείου Οικονομικών περιλαμβάνονται οι εξής:
-Υπηρεσία Πολιτικής Αεροπορίας
-Εθνική Επιτροπή Τηλεπικοινωνιών και Ταχυδρομείων
-Αρχή Συντονισμού Πτήσεων
-Επιτροπή Διερεύνησης Ατυχημάτων & Ασφάλειας Πτήσεων
-Επιτροπή Διερεύνησης Σιδηροδρομικών Ατυχημάτων και Συμβάντων
-Ρυθμιστική Αρχή Σιδηροδρόμων
-Σώμα Επιθεωρητών – Ελεγκτών Υπουργείου Μεταφορών και Επικοινωνιών
-Σώμα Επιθεωρητών Ασφάλειας Πτήσεων (στην Υ.Π.Α.)
-Οργανισμός Σιδηροδρόμων Ελλάδος
-ΕΡΓΟΣΕ
-ΤΡΑΙΝΟΣΕ
-ΓΑΙΑΟΣΕ Α.Ε
-Σιδηροδρομικό Μουσείο Αθηνών
-Οργανισμός Αστικών Συγκοινωνιών Αθηνών
-Αττικό Μετρό
-Ελληνικά Ταχυδρομεία
-Ταχυμεταφορές ΕΛ.ΤΑ
-Κέντρο Επαγγελματικής Κατάρτισης
-Τεχνικό Επιμελητήριο Ελλάδος
-Οργανισμός Αντισεισμικού Σχεδιασμού και Προστασίας
-Εταιρεία Ύδρευσης και Αποχέτευσης Πρωτεύουσας
-Εταιρεία Ύδρευσης και Αποχέτευσης Θεσσαλονίκης
-Εταιρεία Πάγιων ΕΥΔΑΠ
-Εταιρεία Ύδρευσης και Αποχέτευσης Θεσσαλονίκης Παγίων
-Οργανισμός Εργατικής Κατοικίας
-Ανώνυμη Εταιρεία Εκμετάλλευσης και Διαχείρισης Ελληνικών Αυτοκινητόδρομων
-Εγνατία Οδός
-Ινστιτούτο Εκπαίδευσης και Επιμόρφωσης Μελών Τεχνικού Επιμελητηρίου Ελλάδας
-Ινστιτούτο Οικονομίας Κατασκευών
-Οργανισμός Σχολικών Κτιρίων
-Υποδομές, Μεταφορές και Δίκτυα Ανάπτυξης Κρήτης