Έντονη κριτική στην κυβέρνηση ασκεί το Ποτάμι για το ζήτημα της διδασκαλίας των Θρησκευτικών και τη συνδρομή της Εκκλησίας.
Συγκεκριμένα αναφέρει σε ανακοίνωση του: «Ήταν να μην πάρει φόρα ο κ. Τσίπρας, υπογράφει παντού μνημόνια. Νέο μνημόνιο “συνεργασίας” με την Εκκλησία αυτή τη φορά, καθώς σύμφωνα με σημερινές δηλώσεις του Αρχιεπισκόπου Ιερώνυμου, η Εκκλησία θα συναποφασίζει με την Πολιτεία σχετικά με τη διδασκαλία και το περιεχόμενο του μαθήματος των Θρησκευτικών, και μάλιστα μετά από έγκρισή της, θα τυπώνονται τα νέα σχολικά βιβλία.
Αν και μπορούμε να αντιληφθούμε την ανάγκη της Εκκλησίας να υποστηρίξει τις θέσεις της, απορούμε που πήγε και αυτή η κόκκινη γραμμή του ΣΥΡΙΖΑ για τον διαχωρισμό Κράτους-Εκκλησίας όταν δεν το τολμά ούτε για τη διδασκαλία των θρησκευτικών.
Τελικά μετά και την “άδολη” συνηγορία του ΣΥΡΙΖΑ υπέρ του κ. Καμμένου σε οτιδήποτε κάνει, φανερά ή κρυφά, μάλλον θα πρέπει να αλλάξει η μαρκίζα στην κυβέρνηση από ΣΥΡΙΖΑ-ΑΝΕΛ σε ΑΝΕΛ-ΣΥΡΙΖΑ».