Για λόγους αυστηρά προσωπικούς και επαγγελματικούς, όπως έχει εξηγήσει στον πρωθυπουργό και στον Υπουργό Αγροτικής Ανάπτυξης, ο Γενικός Γραμματέας του Υπουργείου Νίκος Στουπής υπέβαλε την παραίτησή του.
Όπως ανέφερε ο ίδιος: «Για λόγους ανυπέρβλητους, αυστηρά προσωπικούς και επαγγελματικούς, είχα διατυπώσει προς τον Υπουργό Αγροτικής Ανάπτυξης και τον Πρωθυπουργό της χώρας αίτημα αντικατάστασης από την θέση του Γενικού Γραμματέα εδώ και σαράντα μέρες. Οποιαδήποτε διαφορετική ερμηνεία της επιλογής μου αυτής δεν έχει ουδεμία βάση.
Στον ένα κοντά χρόνο πολιτικής ευθύνης που λειτούργησα – αρχικά σαν Πρόεδρος του ΕΛΓΑ και στην πορεία ως Γενικός Γραμματέας του ΥΠΑΑΤ-, προσπάθησα διαθέτοντας όλο μου το χρόνο και τα ψυχικά μου αποθέματα να υπηρετήσω την συμφωνημένη Κυβερνητική Πολιτική διεξόδου από την μνημονιακή κρίση της χώρας, με το λαό μας όρθιο, και δημιουργίας προϋποθέσεων για την παραγωγική της ανασυγκρότηση .
Πιστεύω απόλυτα στην μακροημέρευση της Κυβέρνησής μας και σε θετικά αποτελέσματα των ιστορικών ευθυνών που έχει αναλάβει. Ευελπιστώ σε επόμενη φάση να έχουν εκλείψει οι αιτίες των προβλημάτων που με απασχολούν και να ξανασυμμετάσχω ενεργά και ανεξαρτήτου θέσεως στην συλλογική μας προσπάθεια».